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endosome
V2EX  ›  问与答

做生物信息学分析,求 Python 和 R 教程

  •  
  •   endosome · 2016-05-20 11:00:33 +08:00 · 2898 次点击
    这是一个创建于 3108 天前的主题,其中的信息可能已经有所发展或是发生改变。
    因工作中需要许多 dry lab 的数据分析,因此需要自学 Python 和 R 教程,用于生物大数据分析和文章发表。
    求易于上手的教程或者 textbook 。
    谢谢
    8 条回复    2016-05-21 00:09:44 +08:00
    lbp0200
        1
    lbp0200  
       2016-05-20 11:07:50 +08:00 via Android
    慕课网有视频
    DaPanda
        2
    DaPanda  
       2016-05-20 11:14:29 +08:00
    可以看看 [Python for Informatics]( http://www.pythonlearn.com/book.php) ,专门为以信息处理为目的的 Python 入门教材,很实用。
    yech1990
        3
    yech1990  
       2016-05-20 13:20:54 +08:00
    生物有毛线大数据, 不要跟风
    Geeker
        4
    Geeker  
       2016-05-20 13:29:42 +08:00
    《集体智慧编程》
    《 R 语言实战》
    endosome
        5
    endosome  
    OP
       2016-05-20 20:25:53 +08:00 via iPhone
    @yech1990 几千万甚至上亿的序列,手工没法完成吧。实际需要,不是跟风
    yech1990
        6
    yech1990  
       2016-05-20 23:18:02 +08:00 via Android
    @endosome 这也就是几百 M 的 reads 。
    分分钟的事,不要扯什么大数据
    endosome
        7
    endosome  
    OP
       2016-05-21 00:07:52 +08:00
    @yech1990 咱乡下作坊没有见识过大数据,见过的最大世面就是一个样品做出来几千万几亿的序列。
    以前几百个序列还可以手工操作;对于上亿的序列,我觉得需要写一点 script ,才能完成既定的分析任务。
    在我和我的同事眼里,这就是大数据, big data
    endosome
        8
    endosome  
    OP
       2016-05-21 00:09:44 +08:00
    @DaPanda looks cool. Appreciate it.
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