要在同一个文件声明多个模块，就像 2L 说的一样，显式在 define 第一个参数指定模块名。文档里说是不推荐这么做的，而是统一约定一个文件一个模块，用文件名表示模块名。

楼主贴的这段代码是 Optimizer 生成的。它把每个文件的代码嵌入到了一个自调用里：
(function () {
// my-module-foo.js
}).call(this),
(function () {
// my-module-bar.js
}).call(this);

因为这时所有模块合并到了一个文件，没法用文件名做模块名了。所以 Optimizer 把原来的文件名加到了 define 第一个参数。
(function () {
// my-module-foo.js
define("my-module-foo", [], function { /* ... */ });
}).call(this),
(function () {
// my-module-bar.js
define("my-module-bar", [], function { /* ... */ });
}).call(this);

所以就有了这样的结构。